36 genů spojených s homologous recombination repair (HRR), 5 genů spojených s mismatch repair (MMR) 

HRR geny: ATM, ATR, BAP1, BARD1, BLM, BRCA1/2, BRIP1, CDK12, CHEK1/2, FAM175A, FANCA/C/E/F/G/I, FANCL/M/D2, MRE11, NBN, PALB2, PPP2E2A, RAD50/51/52, RAD54B/L, RAD51B/C/D, RPA1, XRCC2/3. 

MMR geny: PMS2, MSH6, EPCAM, MLH1, MSH2. 

15 driver genů TP53, PTEN, PIK3CA, CDH1, ARID1A, BRAF, KRAS, CDKN2A, CTNNB1, EGFR, POLE, ATRX, STK11, SMAD4 a NRAS. 

3 typy genomické instability: loss of heterozygosity (LOH), telomeric allelic imbalance (TAI) a large end shift (LST) detekované na základě malých insertion/deletion (InDel) ve 42 500 SNP. Výpočet Genomic Instability Score (GIS) pro určení homologous recombination deficiency (HRD) statusu